Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb7P09024 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms