Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NefmP08553 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NefmP08553 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NefmP08553 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NefmP08553 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NefmP08553 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NefmP08553 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NefmP08553 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NefmP08553 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefmP08553 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefmP08553 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefmP08553 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NefmP08553 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefmP08553 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefmP08553 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NefmP08553 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefmP08553 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefmP08553 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NefmP08553 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NefmP08553 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NefmP08553 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NefmP08553 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NefmP08553 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NefmP08553 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NefmP08553 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NefmP08553 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NefmP08553 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NefmP08553 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NefmP08553 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NefmP08553 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefmP08553 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefmP08553 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefmP08553 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefmP08553 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefmP08553 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefmP08553 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefmP08553 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefmP08553 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefmP08553 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefmP08553 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NefmP08553 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NefmP08553 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NefmP08553 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NefmP08553 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NefmP08553 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NefmP08553 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NefmP08553 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NefmP08553 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NefmP08553 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NefmP08553 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NefmP08553 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms