Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeflP08551 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NeflP08551 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeflP08551 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NeflP08551 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeflP08551 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeflP08551 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeflP08551 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeflP08551 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeflP08551 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeflP08551 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeflP08551 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeflP08551 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeflP08551 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeflP08551 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeflP08551 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeflP08551 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeflP08551 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeflP08551 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeflP08551 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeflP08551 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NeflP08551 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NeflP08551 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NeflP08551 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NeflP08551 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NeflP08551 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NeflP08551 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NeflP08551 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NeflP08551 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NeflP08551 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NeflP08551 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NeflP08551 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeflP08551 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeflP08551 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NeflP08551 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms