Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spta1P08032 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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