Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms