Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04224 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04224 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04224 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04224 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04224 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04224 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04224 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04224 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04224 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
P04224 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04224 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04224 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04224 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms