Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-K1P01901 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-K1P01901 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms