Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms