Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1O88746 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1O88746 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1O88746 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1O88746 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tom1O88746 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms