Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd7O88665 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd7O88665 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms