Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dync1i1O88485 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms