Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms