Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme6O88425 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms