Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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