Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CtssO70370 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtssO70370 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtssO70370 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtssO70370 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtssO70370 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtssO70370 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtssO70370 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtssO70370 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtssO70370 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtssO70370 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtssO70370 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtssO70370 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtssO70370 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtssO70370 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms