Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtogO55225 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtogO55225 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtogO55225 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtogO55225 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtogO55225 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
OtogO55225 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
OtogO55225 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtogO55225 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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OtogO55225 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtogO55225 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtogO55225 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtogO55225 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtogO55225 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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