Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb2O55203 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.3 ms