Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt5hO55201 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt5hO55201 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms