Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pja1O55176 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja1O55176 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pja1O55176 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pja1O55176 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms