Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms