Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms