Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LatO54957 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LatO54957 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LatO54957 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LatO54957 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LatO54957 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LatO54957 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms