Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Sp100O35892 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Sp100O35892 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Sp100O35892 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sp100O35892 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sp100O35892 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sp100O35892 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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