Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms