Protein–RNA interactions for Protein: O35701

Matn3, Matrilin-3, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn3O35701 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Matn3O35701 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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