Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PnnO35691 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PnnO35691 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PnnO35691 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PnnO35691 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnnO35691 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnnO35691 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnnO35691 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnnO35691 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnnO35691 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnnO35691 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnnO35691 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PnnO35691 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnnO35691 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnnO35691 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnnO35691 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PnnO35691 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnnO35691 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnnO35691 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnnO35691 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnnO35691 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnnO35691 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PnnO35691 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PnnO35691 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PnnO35691 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PnnO35691 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PnnO35691 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnnO35691 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnnO35691 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnnO35691 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnnO35691 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PnnO35691 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PnnO35691 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnnO35691 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnnO35691 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnnO35691 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnnO35691 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PnnO35691 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms