Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d1bO35324 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms