Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms