Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcns1O35173 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms