Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarb2O35114 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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