Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ArxO35085 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ArxO35085 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ArxO35085 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ArxO35085 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ArxO35085 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ArxO35085 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ArxO35085 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ArxO35085 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ArxO35085 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArxO35085 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArxO35085 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArxO35085 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ArxO35085 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArxO35085 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArxO35085 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArxO35085 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArxO35085 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArxO35085 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ArxO35085 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms