Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms