Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casp6O08738 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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