Protein–RNA interactions for Protein: O08644

Ephb6, Ephrin type-B receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb6O08644 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb6O08644 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms