Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20939L7N243 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20939L7N243 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms