Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21900J3QP38 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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