Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim18J3QNP2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Smim18J3QNP2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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