Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn34c2J3QNM1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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