Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Gm20873J3QMQ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Gm20873J3QMQ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Gm20873J3QMQ9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Gm20873J3QMQ9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Gm20873J3QMQ9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Gm20873J3QMQ9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20873J3QMQ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20873J3QMQ9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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