Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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