Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn20G5E8X0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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