Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgxb3G3X9M3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms