Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zc3h12bG3X9I7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zc3h12bG3X9I7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms