Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm16519F8VQK7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms