Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5160F8VPN3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5160F8VPN3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms