Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms