Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm8005F6YKY3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm8005F6YKY3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm8005F6YKY3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm8005F6YKY3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm8005F6YKY3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm8005F6YKY3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm8005F6YKY3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm8005F6YKY3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Gm8005F6YKY3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm8005F6YKY3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm8005F6YKY3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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