Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10477F6SW83 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms