Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApobE9Q414 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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