Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms